自清康熙以来，为开辟苗疆，正逐渐实行改土归流，随着改土归流之后，汉民族大量涌入，汉民族先进的生产力强烈影响着苗族人民，也大量的侵占着苗区人民的土地，导致大量的苗民破产，或沦为汉族地主的佃农，或逃往更加偏僻的山区。据记载，自改土归流后，生苗区大都被纳入国家版图之中。如：“王申，鄂尔泰奏剿办仲苗就抚者二十一寨，查出熟地荒地三万余亩。”“湖广镇筸红苗吴老化率毛都塘等五十二寨内附。镇筸苗民续内附八十三寨。”这些被迫归附或强制征服的苗民，开始受到了国家的正式管理。但最初的时候，对苗汉之间还是有诸多限制的。如：“防守红苗，沿边设塘讯，禁内地民与苗往来。”、“苗疆禁例……各省民人无故擅入苗地，及苗人无故擅入民地，均照例治罪”、“苗汉不准通婚”等等。由于汉民族大量迁入苗区，以及随之带来的土地资源的争夺，并在不断增多的人口压力，满汉流官的专横、某些汉民的仗势欺人，诸多禁令的压制下，促使反抗的加剧并最终爆发举兵起事。

    康熙二十四年（1685），镇筸补丁寨红苗苗酋吴二哥、吴老览、吴老叟等人，率领苗族人民起事，反抗清朝政府，响应者近万人。辰州左督郭忠孝率领守备陈赤和徐三奇、水师守备张其蕴等官兵前往乾州镇压，反为起事民军所败。之后，制府徐国相与偏沅巡抚丁恩孔、提督徐志都出兵征剿。清康熙帝玄烨命郭忠孝为总统，分巡道王舜年监军于前，辰州知府刘应中、沅州总兵姚仪督兵于后，点副将勒起功、赵文实，游击将军王子明、守备胡奇、刘旭、督、抚、提、镇各协营官兵都来会师。为彻底剿灭苗反，又调永顺、保靖两土司领“土兵”赴援。地良坡一战，尸横遍野，血流成河，起事军伤亡惨烈，战死者二千七百余人。吴二哥、吴老览、吴老叟领众退守补丁寨，扼险据守。因地势险要，清军一时进攻不了，遂绕道暴木营，实行前后夹击，连续血战四昼夜，起事民军伤亡更大，被迫突围，往茨岩遁走。郭忠孝率军紧追不舍，生擒吴老览。吴二哥、吴老叟身负重伤，血战而死，被清军斩首示众。起事军余部在吴辣儿的领导下，在暴木营、鸭保寨、龙蚁岗一带，继续抗击清军。康熙二十五年（1686）正月，吴辣儿率众退据天星山，与清军相持月余，终因弹尽粮绝，全部战死。

    清康熙四十二年（1703），镇筸五寨长官司治下石老虫领导苗民，又掀起了大规模的反“征服”的武装斗争，史称红苗起义。清朝廷派遣礼部尚书席尔达、京都大臣副都统图思海、徐九如，领荷州驻防满兵一千名，并同湖广总督喻成龙、湖南巡抚赵中乔、湖南提督俞益谟、贵州提督李芳述、广西提督张旺等率领广西、贵州、湖南三省满汉官兵，直逼镇筸，勒令“归诚”。在强大的清军面前，苗民毫不屈服，他们在石老虫的率领下，活动在以天星寨、暴木营、毛都塘、老家寨、马坡山、两头羊、打郎、湄亮、糯塘山、七蔸树、龙蛟岗、排六梁等为根据地。攻打五寨长官司、筸子坪长官司以及沅州麻阳、乾州厅一带，并得到铜仁、松桃等地苗民纷纷起兵响应。一时，官军围剿不了。直到康熙四十五年（1706），朝廷礼部尚书席尔达，同湖广总督喻成龙率湖南、广西、贵州三省巡抚与提督，以及镇筸总兵雷如、长沙副将高一靖、永州总兵包成、沅州副将韩琪、保靖土司彭泽虹，率满、汉土兵共八万兵会剿镇筸。通过围剿，终于在天星山一场大决战，苗军三千余人战死，起事宣告失败。但苗军余部仍藏于天星山一带，与清军周旋，坚持斗争了十余年。

    这次苗民起事，波及三百三十三个苗寨，四千七百户苗民，尤以两头羊、毛都塘、糯塘山、老旺山、马鞍山、天星山、七蔸树、打郎、湄亮、龙蛟岗、排六梁、上下葫芦、蔸河、暴木营等地为甚。清军分五路进兵，苗军据险守隘，多次重创官军，但终因寡不敌众而失败。这次反抗斗争，苗兵战死者四千六百五十余人，被生擒男女老幼一百五十多人。

    清康熙五十八年（1719），靖州取消“蛮不入境，汉不入峒”的条例，湖南省内外汉族农民、商人、手工业者纷纷涌入苗疆。清雍正四年（1726），清政府在五溪采取“剿抚兼施”、“恩威并用”的政策，对湘西各大小土司进行改流。清雍正五年（1727）时，朝廷通过官府发出禁令，“禁民、苗结婚，禁兵、民与苗借债卖产，禁苗俗。”受到苗、汉人民的普遍抵制。

    雍正十二年，清政府以军装被劫为由，竟诬陷绥宁苗酋凤老一，城步苗酋蒲寅山所为，请求派官兵前往苗疆搜捕。蒲寅山（？-1738），别号罗卜王，清代农民军领袖。城步县大水图家浆山（今柳寨乡）人。自幼习武，秉性剽悍，好打抱不平，在扶城峒、大水图一带苗、瑶各寨中颇有威望。清雍正六年（1728），喜塔拉氏向雍正皇帝上疏，奏准采用“雕剿法”治苗。于是，武冈营及城步县署下令并多次进入寨收缴环刀、标枪等自卫兵器，还规定苗、瑶“以物往市，先报地方官知会，塘讯查验”，蒲寅山等苗瑶酋长对此极为不满。

    雍正十二年，城步知县蒋德重会同武冈营游击蓝美林在苗、瑶各寨进行收缴，任意捕人。蒲寅山秘密串通苗酋凤老一，在家浆山、竹岔山一带，凭藉高山险阻 ，“纠众拒官兵，杀伤官吏”，举兵起事。

    雍正十三年（1735），清政府改土归流完成。是年，蒲寅山起事民军从根据地竹岔山扩张到扶城峒应声岩、横岭峒绥宁县黄桑坪一带，并在应声岩击败前来征剿的知县蒋德重、武冈营游击蓝美林和永州千总龚作率领的官兵。

    乾隆元年（1736），宝庆协把总李如松率兵攻家浆山，也被民军杀死。乾隆三年，清朝廷为了加强对蒲寅山民军的防御和镇压，移新化县白面巡检司至城步县寨头，置寨头巡检司，常驻官兵节制竹岔山下的苗、瑶、土民。四月，襄阳总兵李琦受湖广总督之命，率三千余官兵进攻竹岔山。蒲寅山、凤老一诱敌于龙开口，李琦中埋伏大败，清军死三百多人。六月，沅、辰两州府增兵三千救援。这次李琦用重金收买民军中内奸引路，从家浆山攀缘而上竹岔山，从背后偷袭苗营，民军腹背受敌。蒲寅山突围时战死，民军大部分被官军所杀，附近苗、瑶各寨男丁或隐避他乡，或被官兵滥杀。“妇女及五岁以下幼儿，被官兵在隔越外疆处变卖，得价以分赏有功兵丁。”这就是史称的“竹岔山惨案”。